當組織建立了環境管理體系之后，通過管理活動程序、建立規范化文件和記錄等措施可以協調不同的職能部門之間的關系，并可以達到下列目的：

1、建立良好的環境方針和環境管理基礎；

2、有利于找出并控制重大的環境因素和影響；

3、有利于識別有關的環境法規要求與現行狀況的差距；

4、減少由于污染事故或違反法律法規所造成的環境影響；

5、建立組織內污染防止優先序列，并為實現污染預防目標而努力；

6、可以提高監測環境的能力和評價該體系的效率，包括促進體系的改進和調整，以適應新的和不斷變化的情況和要求；

7、由于改善環境從而帶來許多重要的商業、環境機會。

總之，環境管理體系將有助于組織系統化地處理環境問題，并將環境保護和企業經營結合起來，使之成為企業日常運行和經營策略的一個部分。